玉溪历史上在先秦时期为古滇国核心地带。
汉元鼎六年(公元前111年)设爿羊爿可 郡,华宁属毋单县;汉元封二年(公元前109年)滇王降,汉置益州郡,郡置设滇池县(晋宁)、双柏县(易门)、俞元县(峨山)等;蜀汉时属南中;南北朝及隋代设南宁州,实为爨氏所控制;唐设南宁都督府,后为南诏拓东节度使辖地;宋时为大理国所属;元为中书省辖地;明代分属昆阳州、澄江府、临安府、宁州、元江府;清承明制,分属云南府、澄江府、临安州、新兴州、元江直隶州等;民国时期废府设道,玉溪市又分属蒙自道、普洱道、滇中道。
1950年1月成立滇中区人民行政专员公署,同年3月改称玉溪行政专员公署;1983年玉溪撤县改市(县级);1997年12月13日国务院批准撤销云南省玉溪地区建立玉溪市(地级)。
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